杭州上海烈冰生物单细胞多组学多组学测序

随着单细胞转录组测序技术（scRNA-Seq）的蓬勃发展，其在在胚胎发育，肿瘤细胞异质性，免疫细胞转化等多方面屡建奇功，但是由于细胞形态的不同和单细胞制备中细胞敏感性的差异等因素影响，scRNA-Seq在数据分析时可能会出现细胞类型占比失真，个别细胞类型丢失等情况。为了克服单细胞测序技术的局限性，单细胞核转录组测序技术（snRNA-Seq）应运而生，snRNA-Seq可利用冻存组织直接制备单细胞核进行转录组测序，不仅克服了细胞形态差异致使的细胞捕获差异，还克服了单细胞测序必须使用新鲜样本的多个局限性。单细胞多组学技术可在同一细胞中捕获分析两种以上的组学信息,包括转录组、基因组、表观基因组、蛋白组等。杭州上海烈冰生物单细胞多组学多组学测序

如在现有研究方法基础上，进行特定亚细胞区域的蛋白质组学、相互作用蛋白质组学以及某种特定翻译后修饰类型的蛋白质组学的研究等。这将有助于诸多生化过程以及致病机理的全新认识与发现。随着基于单细胞蛋白质组学质谱研究方法的不断发展，单细胞分析方法的灵敏度、蛋白质的覆盖度、细胞通量、空间分辨率以及多组学的兼容能力会不断突破我们的认知极限。更重要的是，单细胞分析在临床诊断、疾病分型以及细胞发展机制这些重大生命科学领域方面的应用将会越来越大。厦门scRNA单细胞多组学数据分析随着单细胞多组学的不断进步, 研究者将有机会在单细胞分辨率下进一步理解个体发育以及疾病发展机制。

基因测序是基因检测的方法之一，其又叫基因谱测序，是国际上公认的一种基因检测标准。高通量测序技术是对传统测序一次颠覆性的改变，一次对几十万到几百万条核酸序列进行测定，被称为下一代测序技术(nextgenerationsequencing)，足见其划时代的改变，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序(deepsequencing)。基因测序相关产品和技术已由实验室研究逐渐演变到临床应用，可以说，基因测序技术将是下一个改变世界的技术。

针对单细胞测序的细胞数量判断环节：主要是对细胞数量、基因表达量、测序质量进行整体描述。过滤标准：由于细胞破碎后游离RNA会释放到环境或孔中，并且测序中也会存在一些死细胞，导致数据存在background值。因此，我们需要设定一定的标准来过滤掉假细胞或死细胞。以10×Genomics为例，细胞数量判断主要通过分析UMICounts-Barcode曲线斜率拐点，当存在多个斜率拐点的时候，结合预期UMI=500时的细胞数量进行过滤。当斜率拐点低于UMI=500的时候，选择UMI=500作为细胞的判断的标准；否则，选择和预期细胞数量非常接近的拐点作为细胞判断的位置。这样我们能够有效获得真实的并且在基因数量上可以分析的数据。目前已应用的单细胞多组学联合分析包括转录组和基因组，转录组和ＤＮＡ甲基化、转录组和蛋白组。

其实，空间转录组的概念早就已经存在了，目前已经发表的空间转录组技术有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。但是这些方法存在操作复杂、检测精度不准确、基因和细胞检测量的限制等问题。10xGenomics公司升级spatialTranscriptomic后推出的Visium空间基因表达解决方案是一款商业化的高精度、高通量空间转录组测序方案。烈冰科技自2020年起，国内率先搭建空间转录组测序服务平台，联合上线单细胞核转录组测序、AbSeq、单细胞TCR-Seq、单细胞ATAC-Seq(ARCHR测序）、空间转录组测序产品结合scRNA-Seq服务，多组学联合助力科研人员探索时空等多维度、多角度的动态变化的生物学信息。烈冰生物为您提供贴心的单细胞研究完整解决方案！随着组学新技术的不断涌现，高通量的方向发展，通过对多组学数据的整合分析，已成为科研究新方向。重庆烈冰生物单细胞多组学多组学测序

烈冰科技已建立了基于单细胞测序的高通量测序实验多平台。杭州上海烈冰生物单细胞多组学多组学测序

单细胞多组学技术优势：1. 构建蛋白质数据库，大幅度提高蛋白质鉴定数量；2. 不同层面表达水平分析，构建表达“全景图”；3. 多组学交叉验证：深层次挖掘其中调控机制；4. 对基因突变信息在蛋白水平上进行验证；5.精细医疗：实现genomics到protegenomics的转变。生物领域各个研究方面，1. 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等；2. 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等；3. 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型等；4. 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；5. 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；6. 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等；7. 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等；8.食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等。杭州上海烈冰生物单细胞多组学多组学测序

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